Nouvel outil diagnostique (MinION) pour l'identification des micro-organismes dans les plaies du pied chez les patients atteints d'ostéite du pied diabétique
Les infections des plaies du pied diabétique sont majoritairement polymicrobiennes. Cependant, la culture microbiologique « conventionnelle » ne permet pas d'identifier toutes les bactéries potentiellement impliquées dans ces infections et nécessite du temps, ce qui peut avoir un impact négatif en retardant le traitement et/ou la prescription d'une antibiothérapie adaptée. L'analyse métagénomique en temps réel utilisant la technologie MinION d'Oxford Nanopore Technologies a démontré une capacité suffisante pour identifier la quasi-totalité des génomes microbiens présents dans un échantillon donné, en fournissant des informations complémentaires sur leur profil de résistance aux antibiotiques et une prédiction in silico des gènes codant pour des facteurs de virulence en moins de 4 heures. Sur la base de ces résultats rapides, un protocole de prise en charge pourrait être défini spécifiquement pour chaque patient, dans une perspective de médecine personnalisée. L'objectif est d'étudier la diversité des espèces bactériennes et fongiques identifiées par la méthode MinION et de comparer cette diversité aux résultats obtenus par les méthodes conventionnelles (culture de routine) à partir de biopsies osseuses prélevées chez des patients atteints de DFOM.
Non précisée · Réf. NCT07391995
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