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Définition de Sous-phénotypes de Pneumonie Basés Sur la Composition du Microbiome Respiratoire Pour Prédire Les Échecs Microbiens et Cliniques du Traitement

Promoteur : Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 16 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.

Texte original (anglais)

Definition of Sub-phenotypes of Pneumonia Based on the Respiratory Microbiome Composition to Predict Microbial and Clinical Treatment Failures

Background: Pneumonia remains a leading cause of antibiotic consumption globally, contributing significantly to the burden of antimicrobial resistance (AMR). The respiratory microbiome plays a crucial role in the emergence of AMR and therapeutic failure in both community-acquired pneumonia (CAP) and hospital-acquired pneumonia (HAP). The PHENOMENON study aims to investigate the relationship between the respiratory microbiome composition and clinical outcomes to improve the prediction of treatment failure and AMR emergence. Methods: This multicenter prospective cohort study will include 300 adult patients across three cohorts: CAP in general wards, severe CAP in intensive care units (ICU), and ventilator-associated HAP (vHAP/VAP). Patients will undergo oropharyngeal and rectal swabbing at admission (Day 0), Day 3, Day 7-10, and Day 90, along with blood sampling and endotracheal aspirates in intubated patients. The primary objective is to assess the association between baseline respiratory microbiome composition and time to antibiotic response within 7-10 days. The composite primary endpoint includes clinical failure, microbiological failure, or AMR emergence. Secondary endpoints explore the association between microbiome composition and pneumonia recurrence, severity, hospital length of stay, and mortality at Day 28 and Day 90. Expected Outcomes: This study will provide insights into the predictive value of respiratory microbiome composition on antibiotic response and AMR emergence. Understanding these relationships may guide personalized antibiotic strategies and optimize pneumonia management, ultimately reducing treatment failure rates and improving patient outcomes.

Contexte : la pneumonie reste l'une des principales causes de consommation d'antibiotiques dans le monde, contribuant de manière significative au fardeau de la résistance aux antimicrobiens (RAM). Le microbiome respiratoire joue un rôle crucial dans l'émergence de la RAM et l'échec thérapeutique, tant dans la pneumonie communautaire (PAC) que dans la pneumonie nosocomiale (PN). L'étude PHENOMENON vise à examiner la relation entre la composition du microbiome respiratoire et les résultats cliniques afin d'améliorer la prédiction de l'échec du traitement et de l'émergence de la RAM. Méthodes : cette étude de cohorte prospective multicentrique inclura 300 patients adultes répartis en trois cohortes : PAC en service général, PAC sévère en unité de soins intensifs (USI), et pneumonie nosocomiale associée à la ventilation (vHAP/VAP). Les patients feront l'objet d'un prélèvement oropharyngé et rectal à l'admission (jour 0), au jour 3, au jour 7-10 et au jour 90, ainsi que d'un prélèvement sanguin et d'aspirations endotrachéales chez les patients intubés. L'objectif principal est d'évaluer l'association entre la composition initiale du microbiome respiratoire et le délai de réponse à l'antibiothérapie dans les 7 à 10 jours. Le critère d'évaluation principal composite comprend l'échec clinique, l'échec microbiologique ou l'émergence de la RAM. Les critères secondaires explorent l'association entre la composition du microbiome et la récidive de pneumonie, la sévérité, la durée d'hospitalisation et la mortalité au jour 28 et au jour 90. Résultats attendus : cette étude apportera des éléments sur la valeur prédictive de la composition du microbiome respiratoire sur la réponse aux antibiotiques et l'émergence de la RAM. La compréhension de ces relations pourrait guider des stratégies antibiotiques personnalisées et optimiser la prise en charge de la pneumonie, réduisant ainsi les taux d'échec du traitement et améliorant les résultats pour les patients.

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