Diversité génomique et phénotypique des souches d'Escherichia coli productrices de carbapénémases circulant dans le sud de la France
Les entérobactéries productrices de carbapénémases (EPC) sont classées parmi les bactéries hautement résistantes émergentes (BHRe) car elles exposent les patients infectés à un risque d'échec thérapeutique en raison de la résistance des souches aux bêta-lactamines de dernier recours, les carbapénèmes, et d'une co-résistance fréquente à d'autres classes d'antibiotiques, entraînant une morbidité et une mortalité accrues. Leur fort potentiel épidémiogène a permis leur diffusion mondiale. En France, l'incidence des entérobactéries productrices de carbapénémases augmente fortement, tant en colonisation qu'en infection. Parallèlement à cette augmentation, Escherichia coli est devenue l'entérobactérie productrice de carbapénémases la plus fréquente (35 % des souches en 2024, données du Comité national de recherche), devançant Klebsiella pneumoniae (24 %). Les investigateurs formulent l'hypothèse que l'augmentation de la prévalence des Escherichia coli productrices de carbapénémases est associée à une diversification des clones, des enzymes et de leurs variants, et pourrait constituer une triple menace : i) la diffusion des gènes codant les carbapénémases au sein des pathovars d'Escherichia coli extra-intestinaux pathogènes (ExPEC) responsables d'infections urinaires et de bactériémies, avec un risque élevé de diffusion de la résistance en milieu communautaire, ii) la diffusion silencieuse de souches d'Escherichia coli productrices de variants d'OXA-48 à activité hydrolytique réduite envers les carbapénèmes, OXA-244 et OXA-484, qui ne sont pas détectées ou mal détectées par les milieux de dépistage classiquement utilisés, et iii) l'émergence de variants de la New Delhi métallo-bêta-lactamase (NDM) à forte activité hydrolytique, tels que NDM-5, au sein de clones d'Escherichia coli possédant des protéines liant la pénicilline (PLP) à faible affinité pour les antibiotiques, entraînant une résistance de très haut niveau et une impasse thérapeutique chez les patients infectés.
Non précisée · Réf. NCT07676513
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