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PITCHER (Hétérogénéité de la carcinose péritonéale)

Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 15 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.

Texte original (anglais)

PITCHER (Peritoneal Carcinomatosis Heterogeneity)

How epigenetic deregulation affects gene expression patterns in subclones of the same tumor is poorly known. Peritoneal Carcinomatosis (PC) is a condition in which multiple metastases of the same abdominal tumor develop in the peritoneal cavity and intra-peritoneal organs, thus defining different ecosystems of the same cancer. PITCHER addresses the variations in epigenetically regulated gene expression between different subclones of PC in relation with cell mechanoresponses, providing insights on how cancer epigenetic landscapes evolve under environmental pressures and on strategies used by cancer cells to adapt to the transition from one ecosystem to the other. PITCHER is a network of 10 teams from Lyon, Grenoble and Marseille, based on data and specimen collection of patients who have undergone a surgery for a peritoneal carcinomatosis of ovarian or colorectal origin. PC lesions and eventually matched specimens of primary tumors will be collected in the same patients at the time of the surgery or eventually retrieved from already existing samples. Epigenetic landscapes will be analyzed by a bioinformatics pipeline combining exome sequencing, transcriptome and methylome to identify "epigenetic hotspots", and their variations across lesions will be evaluated. These analyses will be realized in fresh (when available) or pre-existing samples. When possible, organoid cultures and animal models will be derived from multicellular structures in peritoneal fluids and membrane, cytoskeletal and nucleoskeletal mechanoresponses will be characterized using Atomic Force Microscopy. The role of tumor axonogenesis, a process of neo-formation of axon fibers in tumors, will be addressed. Experimental studies of cell responses to therapy will be performed to derive mathematical predictive models. All components will be integrated in a systems biology map of PC.

La manière dont la dérégulation épigénétique affecte les profils d'expression génique dans les sous-clones d'une même tumeur est peu connue. La carcinose péritonéale (CP) est une situation dans laquelle de multiples métastases d'une même tumeur abdominale se développent dans la cavité péritonéale et les organes intrapéritonéaux, définissant ainsi différents écosystèmes d'un même cancer. PITCHER s'intéresse aux variations de l'expression génique régulées épigénétiquement entre différents sous-clones de CP en lien avec les mécanoréponses cellulaires, apportant des éléments sur la manière dont les paysages épigénétiques du cancer évoluent sous pression environnementale et sur les stratégies utilisées par les cellules cancéreuses pour s'adapter au passage d'un écosystème à l'autre. PITCHER est un réseau de 10 équipes de Lyon, Grenoble et Marseille, fondé sur le recueil de données et d'échantillons de patients ayant subi une chirurgie pour une carcinose péritonéale d'origine ovarienne ou colorectale. Des lésions de CP et, le cas échéant, des échantillons appariés de tumeurs primitives seront prélevés chez les mêmes patients au moment de la chirurgie ou éventuellement récupérés à partir d'échantillons déjà existants. Les paysages épigénétiques seront analysés par un pipeline bio-informatique combinant séquençage de l'exome, transcriptome et méthylome afin d'identifier des « points chauds épigénétiques », et leurs variations d'une lésion à l'autre seront évaluées. Ces analyses seront réalisées sur des échantillons frais (lorsque disponibles) ou préexistants. Lorsque cela sera possible, des cultures d'organoïdes et des modèles animaux seront dérivés de structures multicellulaires présentes dans les liquides péritonéaux et membranaires, et les mécanoréponses cytosquelettiques et nucléosquelettiques seront caractérisées par microscopie à force atomique. Le rôle de l'axonogenèse tumorale, un processus de néoformation de fibres axonales au sein des tumeurs, sera étudié. Des études expérimentales des réponses cellulaires au traitement seront réalisées afin d'établir des modèles mathématiques prédictifs. L'ensemble de ces composantes sera intégré dans une carte de biologie des systèmes de la CP.

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