Recrutement en cours

Nutrition, microbiote intestinal et santé : collecte d'échantillons de selles chez les participants de NutriNet-Santé

Promoteur : Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale, France

Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 14 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.

Texte original (anglais)

Nutrition, Gut Microbiota and Health : Feces Sample Collection in NutriNet-Santé Participants

The gut microbiota is currently attracting increasing attention from the scientific community and also from the general public, as evidence of its role in human physiology has been highlighted. Microbial signatures have also been associated with various pathologies (e.g. obesity, diabetes, gastrointestinal disorders, neurodegenerative diseases), but the causality of these associations is still uncertain. Among the factors that may influence the composition of the gut microbiota (e.g. lifestyle, hygiene, medication, genetics, environment), nutrition would a major role. The major changes in lifestyle and diet observed over recent decades are strongly suspected of disrpting the host-gut microbiota balance. In addition to their nutrient content, our diets also contain other bioactive compounds (e.g. polyphenols) and raise new issues (e.g. temporal structure of diets, food processing, presence of additives or contaminants such as pesticide residues, intake of dietary supplements, dietary exclusions, glycemic index) that is necessary to take into account. Thus, it is mandatory to explore and characterize in a more precise way, within large samples consisting of individuals with varied characteristics, the way in which the composition of the gut microbiota is influenced by the host's diet and its health consequences. The aim of this research is therefore to study the links between nutrition, gut microbiota profiles and health. To do this, the research will implement large-scale stool sample collection from participants in the NutriNet-Santé cohort ("Nutrinautes"), thus constituting a "microbiota" sub-cohort. A target of N=10,000 participants in the NutriNet-Santé cohort will be recruited on a voluntary basis. A selection will then be made among Nutrinautes willing to participate in the research (which may be more numerous than necessary) to maximize the diversity of profiles. Participants will be informed of their selection or non-selection by e-mail. A second stool sample will also be collected 2-3 months after the first for a sub-sample of N=300 to assess intra-individual variability in microbiota profiles. The selected participants will receive a stool self-sampling kit with detailed instructions by post to their home address. The pseudonymized samples will be returned by mail by the participant to the processing laboratory, which will determine their gut microbiota characteristics by 16S rDNA sequencing and/or " shotgun " sequencing. The gut microbiota profiles will then be analyzed in a pseudonymised manner in association with diet and health, using data collected as part of the NutriNet-Santé cohort follow-up (e.g. food consumption, prevalence and incidence of pathologies, biological data, anthropometric characteristics, medication intake, socio-demographic characteristics, lifestyle).

Le microbiote intestinal suscite actuellement un intérêt croissant de la part de la communauté scientifique, mais aussi du grand public, à mesure que son rôle dans la physiologie humaine est mis en évidence. Des signatures microbiennes ont également été associées à diverses pathologies (par exemple, obésité, diabète, troubles gastro-intestinaux, maladies neurodégénératives), mais la causalité de ces associations reste incertaine. Parmi les facteurs susceptibles d'influencer la composition du microbiote intestinal (par exemple, mode de vie, hygiène, médicaments, génétique, environnement), la nutrition jouerait un rôle majeur. Les changements importants du mode de vie et de l'alimentation observés au cours des dernières décennies sont fortement suspectés de perturber l'équilibre entre l'hôte et le microbiote intestinal. Outre leur teneur en nutriments, nos alimentations contiennent également d'autres composés bioactifs (par exemple, les polyphénols) et soulèvent de nouvelles questions (par exemple, la structure temporelle des prises alimentaires, la transformation des aliments, la présence d'additifs ou de contaminants tels que des résidus de pesticides, la prise de compléments alimentaires, les exclusions alimentaires, l'index glycémique) qu'il est nécessaire de prendre en compte. Ainsi, il est indispensable d'explorer et de caractériser de façon plus précise, au sein de larges échantillons composés d'individus aux caractéristiques variées, la manière dont la composition du microbiote intestinal est influencée par l'alimentation de l'hôte et ses conséquences sur la santé. L'objectif de cette recherche est donc d'étudier les liens entre nutrition, profils du microbiote intestinal et santé. Pour cela, la recherche mettra en œuvre une collecte à grande échelle d'échantillons de selles auprès des participants de la cohorte NutriNet-Santé (« Nutrinautes »), constituant ainsi une sous-cohorte « microbiote ». Un objectif de N=10 000 participants de la cohorte NutriNet-Santé sera recruté sur la base du volontariat. Une sélection sera ensuite effectuée parmi les Nutrinautes souhaitant participer à la recherche (qui pourraient être plus nombreux que nécessaire) afin de maximiser la diversité des profils. Les participants seront informés de leur sélection ou non-sélection par e-mail. Un second échantillon de selles sera également collecté 2 à 3 mois après le premier pour un sous-échantillon de N=300 afin d'évaluer la variabilité intra-individuelle des profils du microbiote. Les participants sélectionnés recevront par courrier, à leur domicile, un kit d'auto-prélèvement de selles accompagné d'instructions détaillées. Les échantillons pseudonymisés seront renvoyés par courrier par le participant au laboratoire de traitement, qui déterminera les caractéristiques de leur microbiote intestinal par séquençage de l'ADNr 16S et/ou par séquençage « shotgun ». Les profils du microbiote intestinal seront ensuite analysés de façon pseudonymisée en lien avec l'alimentation et la santé, à l'aide des données recueillies dans le cadre du suivi de la cohorte NutriNet-Santé (par exemple, consommation alimentaire, prévalence et incidence de pathologies, données biologiques, caractéristiques anthropométriques, prise de médicaments, caractéristiques sociodémographiques, mode de vie).

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