Évaluation de la réponse IFN de type I dans la cavité nasale au cours des infections virales respiratoires en service de gériatrie

Présentation

Résumé de l’étude

Le diagnostic des infections virales respiratoires repose généralement sur la recherche des agents pathogènes suspectés d'être à l'origine de l'infection au moyen de tests PCR ciblant l'ADN ou l'ARN de ces agents pathogènes. Un test PCR spécifique est nécessaire pour chaque agent pathogène. Dans la plupart des cas, un dépistage portant principalement sur trois virus spécifiques (SARS-CoV-2, virus respiratoire syncytial (VRS), virus de la grippe) est réalisé en première intention. Cependant, de nombreux virus peuvent être à l'origine de ces infections (adénovirus, métapneumovirus, rhinovirus, virus parainfluenza, bocavirus, etc.). Par conséquent, il n'est pas envisageable de réaliser un test PCR spécifique pour chaque virus susceptible de provoquer des symptômes respiratoires, et les infections virales sont souvent sous-diagnostiquées car le dépistage des virus n'est pas exhaustif. Pour répondre à ce problème, l'analyse de la réponse de l'hôte afin de déterminer l'étiologie microbienne d'une infection peut représenter une alternative innovante pour le diagnostic des infections. Une caractéristique commune à tous les virus est leur capacité à induire des interférons de type I (IFN-I). Ainsi, la mesure de cette réponse IFN-I pourrait aider à orienter le diagnostic des infections respiratoires vers une origine virale. Par ailleurs, la détection d'un virus par PCR dans un échantillon respiratoire peut indiquer une infection active ou récente, mais peut également être observée à la suite d'une infection survenue plusieurs semaines ou mois auparavant. La charge virale dans l'échantillon est un facteur important pour distinguer ces deux scénarios, mais ne permet pas toujours de conclure de façon définitive (certains patients peuvent présenter une charge virale faible tout en ayant une infection active). Il est donc parfois difficile de distinguer, à l'aide d'un test PCR détectant le génome viral, un virus en cours de réplication de traces de matériel génétique viral issues de virus morts. Il est donc nécessaire de disposer de marqueurs pouvant être associés à une infection active/en réplication afin d'aider à l'interprétation en cas de résultat de PCR positif. À l'aide d'écouvillons nasopharyngés prélevés pour le diagnostic de l'infection par le SARS-CoV-2, nous avons pu démontrer qu'il est possible de mesurer la réponse IFN-I. Ces protéines, qui possèdent des propriétés antivirales, sont sécrétées par les cellules immunitaires lors de l'infection afin de limiter la réplication virale. Ainsi, la combinaison d'un dépistage simultané de l'agent pathogène et de la réponse IFN a permis de relier le caractère réplicatif du virus SARS-CoV-2 à la production d'IFN-I. Nos travaux les plus récents sur le SARS-CoV-2 ont ainsi conduit à l'identification d'un marqueur de la réponse IFN-I associé à une réplication virale active, que nous avons confirmé à l'aide de techniques de culture virale qui ne détectent que le virus vivant/infectieux. Cependant, la réponse IFN-I peut être altérée chez les personnes âgées et très âgées, notamment en raison de certaines comorbidités ou traitements, dont la prévalence augmente avec l'âge. L'objectif de cette étude est d'évaluer la réponse IFN-I dans le cadre des infections respiratoires causées par différents virus, dans une population admise en service de gériatrie et une population issue du protocole REFIPA (NCT07239830), une étude conçue pour établir des valeurs de référence des scores d'interféron nasal et sanguin chez des sujets âgés non infectés. Il existe un besoin d'amélioration du diagnostic des infections virales, en particulier dans les services de gériatrie où le poids des infections virales est très important pour les patients, les soignants et l'organisation des soins. Un diagnostic rapide des infections virales permettrait d'optimiser les mesures d'isolement et les protocoles d'hygiène au sein de ces services.