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Collecte de selles de donneurs sains pour l'étude ex vivo des modifications du microbiote induites par des phages laitiers et des antibiotiques : un modèle d'interaction bactérie/hôte (DAIRY-SHAPE)

Collecte de selles de donneurs sains pour l'étude ex vivo des modifications du microbiote induites par des phages laitiers et des antibiotiques : un modèle d'interaction bactérie/hôte

Promoteur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 16 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.

Texte original (anglais)

Collection of Stool From Healthy Donors for the ex Vivo Study of Shifts of Microbiome Induced by Dairy Phages and Antibiotics: a Model of Bacteria/Host Interaction (DAIRY-SHAPE)

Collection of Stool From Healthy Donors for the ex Vivo Study of Shifts of Microbiome Induced by Dairy Phages and Antibiotics: a Model of Bacteria/Host Interaction

The gut microbiota plays a crucial role in health through its involvement in pathogen defense, immune regulation, and nutrient digestion. Microbiota diversity is essential to maintain these functions, and disturbances caused by antibiotic intake or extreme diets can lead to an imbalance (dysbiosis), which is often described as being implicated in numerous diseases as well as in the proliferation of antibiotic-resistant pathogens. The microbiota is defined as the community of microorganisms inhabiting the intestine, including bacteria, viruses, and bacteriophages (phages). These phages, through their ability to destroy the bacteria they infect, play an important role in regulating bacterial populations and could therefore be essential for restoring balance and diversity in the gut. Probiotics, foods that support the microbiota such as dairy products, are of particular interest because the specific interactions between phages and bacteria within these food microbiomes could stimulate microbiota restoration. This study aims to evaluate the effectiveness of phage-based functional foods in restoring intestinal homeostasis and, by extension, improving human health. It will serve as a model to examine how phages present in foods, particularly dairy products, influence gut microbial diversity and to determine whether these phages promote recovery after antibiotic-induced disturbances.

Le microbiote intestinal joue un rôle crucial pour la santé de par son implication dans la défense contre les pathogènes, la régulation immunitaire et la digestion des nutriments. La diversité du microbiote est essentielle au maintien de ces fonctions, et les perturbations causées par la prise d'antibiotiques ou des régimes alimentaires extrêmes peuvent entraîner un déséquilibre (dysbiose), souvent décrit comme étant impliqué dans de nombreuses maladies ainsi que dans la prolifération de pathogènes résistants aux antibiotiques. Le microbiote se définit comme l'ensemble des micro-organismes habitant l'intestin, notamment les bactéries, les virus et les bactériophages (phages). Ces phages, de par leur capacité à détruire les bactéries qu'ils infectent, jouent un rôle important dans la régulation des populations bactériennes et pourraient donc être essentiels pour rétablir l'équilibre et la diversité intestinaux. Les probiotiques, aliments soutenant le microbiote tels que les produits laitiers, présentent un intérêt particulier car les interactions spécifiques entre phages et bactéries au sein de ces microbiomes alimentaires pourraient stimuler la restauration du microbiote. Cette étude vise à évaluer l'efficacité d'aliments fonctionnels à base de phages pour restaurer l'homéostasie intestinale et, par extension, améliorer la santé humaine. Elle servira de modèle pour examiner la façon dont les phages présents dans les aliments, en particulier les produits laitiers, influencent la diversité microbienne intestinale et pour déterminer si ces phages favorisent la récupération après une perturbation induite par des antibiotiques.

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