Diagnostic prédictif de l'entérocolite ulcéro-nécrosante chez les bébés prématurés à l'aide d'une approche d'intelligence artificielle basée sur l'analyse précoce du microbiote fécal
La prématurité concerne environ 7 % des naissances en France. L'entérocolite ulcéro-nécrosante (ECUN) est une complication digestive redoutée. Elle est responsable d'un taux de mortalité allant de 15 à 40 %, taux resté stable ces dernières années, ainsi que d'une morbidité digestive et neurodéveloppementale à moyen et long terme. Sa survenue est imprévisible et brutale, généralement entre 10 et 20 jours de vie, et nécessite une prise en charge immédiate et agressive : soutien hémodynamique, mise à jeun, antibiothérapie systémique, voire chirurgie. La prévention est donc essentielle, mais les mesures systématiques d'efficacité prouvée (allaitement maternel, alimentation entérale précoce, probiotiques multiples) restent rares. De plus, ces mesures préventives ne peuvent être modulées et adaptées individuellement, car il n'est pas possible de prédire finement le risque de développer une entérocolite. Ainsi, l'utilisation d'un test diagnostique prédictif de l'ECUN permettrait d'identifier les prématurés à haut risque et de développer des mesures préventives personnalisées. Des modifications du microbiote digestif précèdent la survenue de l'ECUN, mais il n'a pas été possible d'identifier une signature microbienne reproductible et fiable. En conséquence, la puissance limitée de l'analyse et de l'interprétation du microbiote signifie qu'elle ne peut être utilisée en pratique pour prédire l'ECUN. Notre équipe partenaire (MEDiS) a développé une chaîne bio-informatique (RiboTaxa) permettant d'obtenir la structure précise de communautés microbiennes complexes à partir de données de séquençage métagénomique direct. Des échantillons de selles issus de cohortes internationales (1 562 échantillons, 208 prématurés) ont ensuite été exploités pour entraîner un réseau de neurones profond et générer un test diagnostique prédictif de l'ECUN. Dans une étude locale (10 cas et 10 témoins), la performance diagnostique prédictive de ce test était de 90 %, la 1ère selle identifiée comme « à risque » précédant l'ECUN de 8 jours (extrêmes 4-17 jours), et la 2nde de 2 jours (extrêmes 0-7 jours). Nous souhaitons désormais tester notre technique de diagnostic prédictif sur un plus grand nombre de prématurés dans la région AURA. 1 000 enfants inclus, 200 enfants testés (50 ECUN - 150 témoins).
Jusqu’à 0 ans · Réf. NCT06727877
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