Traitement pré-analytique des échantillons humains pour la qualité de l'analyse du microbiote
Maîtrise de la phase pré-analytique des échantillons de contrôle humains pour l'analyse de qualité et de référence du microbiote dans les études cliniques
Promoteur : University Hospital, Montpellier
Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 13 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.
Texte original (anglais)
Pre-analytical Processing of Human Samples for Microbiota Analysis Quality
Mastery of the Pre-analytical Phase of Human Control Samples for Quality and Reference Analysis of Microbiota in Clinical Studies
The goal of this study is to optimise the pre-analytical process for metagenomic analysis of the microbiota in comparison with the current reference technique. A comparative evaluation will be performed between the following and the reference standard (quickly frozen fresh stool): i) faecal sample collection devices commonly used in France and abroad for metagenomics, metabolomics and culturomics; ii) self-collection device that would allows the collection of faecal material and the generation of aliquots for all possible omic assessments for research purposes, including metagenomic analysis, as well as culturomics and faecal transfer to animal models.
L'étude vise à optimiser le processus pré-analytique de l'analyse métagénomique du microbiote, en comparaison avec la technique de référence actuelle. Une évaluation comparative sera réalisée entre les éléments suivants et l'étalon de référence (selles fraîches congelées rapidement) : i) les dispositifs de recueil d'échantillons fécaux couramment utilisés en France et à l'étranger pour la métagénomique, la métabolomique et la culturomique ; ii) un dispositif d'auto-prélèvement permettant le recueil de matière fécale et la génération d'aliquotes pour l'ensemble des analyses « omiques » possibles à des fins de recherche, y compris l'analyse métagénomique, ainsi que la culturomique et le transfert fécal vers des modèles animaux.
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