Étude de la dynamique écologique et évolutive d'Escherichia coli dans la flore digestive commensale
Promoteur : Assistance Publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP)Tous ses essais recensés
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- Âge annoncé
- 18 à 65 ans
- Sexes admis
- Tous
- Phase
- Non applicable
- Type d’étude
- Observationnelle
Présentation
Résumé de l’étude
Escherichia coli (E. coli) pose un problème majeur de santé publique. E. coli n'est pas seulement un commensal du tube digestif, mais aussi un pathogène opportuniste majeur, première cause d'infections urinaires et première cause de bactériémies. Cependant, la dynamique de colonisation intestinale de l'hôte humain reste mal connue.
Comprendre la dynamique de colonisation est essentiel, car la sélection des principaux caractères d'E. coli que sont la résistance aux antibiotiques et la virulence (la propension à provoquer une infection) s'exerce dans le cadre du commensalisme, au niveau intestinal, et non lors des infections. Cette étude permettra pour la première fois d'étudier la dynamique de colonisation d'E. coli dans une large population d'hôtes sains.
L'objectif principal est de quantifier la succession (gain, perte ou remplacement) des souches d'E. coli dans le microbiote intestinal chez des volontaires sains et de déterminer dans quelle mesure elle dépend des caractéristiques de l'hôte et de la bactérie. Cette étude permettra ainsi de mieux comprendre la dynamique épidémiologique d'E. coli et le développement de certains caractères tels que la résistance aux antibiotiques.
Pour atteindre cet objectif, l'étude se déroulera en deux phases successives : une première phase pilote sera d'abord menée auprès de 50 volontaires sains. Au cours de cette phase pilote, un échantillon de selles sera prélevé. Les souches isolées durant cette phase pilote seront séquencées, ce qui permettra de caractériser les souches présentes ainsi que leurs éventuels changements entre deux prélèvements de selles. Les taux de succession seront estimés.
Le rythme d'échantillonnage optimal, maximisant la précision de l'estimation des taux de succession, sera identifié et retenu pour la seconde phase. Une seconde phase, une étude de cohorte prospective, sera également menée auprès de 200 volontaires sains. Au cours de cette seconde phase, les volontaires sains ayant participé à la première phase pourront poursuivre leur participation, et de nouveaux volontaires seront sélectionnés. Les volontaires sains inclus dans l'étude de cohorte prospective seront suivis au moyen de visites et de prélèvements de selles, dont la fréquence sera définie en fonction des résultats de la phase pilote.
Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 19 septembre 2026. Traduction automatique par Intelligence Artificielle, sans relecture médicale. Elle peut comporter des erreurs : en cas de doute, le texte original fait foi. Le portail reprend une sélection de champs de la fiche (titre, résumé, statut, phase, sexes admis, lieux), traduits en français ; consultez la version originale pour les informations complètes.
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