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Comprendre les déterminants de l'immunité muqueuse et optimiser le diagnostic de l'infection par les variants du SARS-CoV-2

Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 13 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.

Texte original (anglais)

Understanding the Determinants of Mucosal Immunity and Optimizing the Diagnosis of Infection With SARS-CoV-2 Variants

One of the current health challenges in the face of the COVID-19 pandemic that started in Wuhan in 2019, and still responsible for successive waves, is to better understand and diagnose the infection. The new variants - delta, then omicron, which appeared in November 2021 and then their sub-variants BA.2, then BA.4 and 5, and more recently BQ.1 and the sub-variant XBB.1.5 are increasingly transmissible and responsible for some degree of immune escape. Hence the importance of a better understanding of infection- or vaccine-induced immunity in order to optimize existing prophylactic or therapeutic strategies, or even to develop new, more effective ones. Mucosal immunity could play a particularly important role in interrupting the infection cycle at the entry point of the virus. The key role of innate immunity has been demonstrated in particular, via interferons and the composition of the microbiota. Humoral immunity is the best documented. However, it tends to be eroded within a few months. On the other hand, cellular immunity is more stable over time and would largely explain the decrease in severe forms of the disease in vaccinated individuals. The collection of biological resources that will be built up during this study will also allow us to optimize or develop new diagnostic methods, necessary as a complement to vaccination, to effectively slow down the spread of the pandemic and reduce the severity of its impact on the population. The improvement of diagnostic methods will in turn improve the understanding of the infection by providing increasingly reliable information on the characteristics of an infection, its quantification, its dynamics, and its resolution, especially since these parameters will be compared, at any time during the study, with reference methods and the immunological status of the subject. The main significant improvements expected in the field of SARS-CoV-2 diagnosis are notably the improvement of performance (reduction of false negatives in RT-PCR on nasopharyngeal samples), acceptability, simplicity of implementation in the field, and the capacity to test transmission. The objective of this study is to identify and characterize SARS-CoV-2 infection and host response, particularly mucosal immunity.

L'un des défis de santé actuels face à la pandémie de COVID-19 qui a débuté à Wuhan en 2019, et qui reste responsable de vagues successives, est de mieux comprendre et diagnostiquer l'infection. Les nouveaux variants - delta, puis omicron, apparu en novembre 2021, puis ses sous-variants BA.2, puis BA.4 et 5, et plus récemment BQ.1 et le sous-variant XBB.1.5 - sont de plus en plus transmissibles et responsables d'un certain degré d'échappement immunitaire. D'où l'importance d'une meilleure compréhension de l'immunité induite par l'infection ou la vaccination afin d'optimiser les stratégies prophylactiques ou thérapeutiques existantes, voire d'en développer de nouvelles, plus efficaces. L'immunité muqueuse pourrait jouer un rôle particulièrement important dans l'interruption du cycle infectieux au point d'entrée du virus. Le rôle clé de l'immunité innée a notamment été démontré, via les interféron et la composition du microbiote. L'immunité humorale est la mieux documentée. Cependant, elle tend à s'estomper en quelques mois. En revanche, l'immunité cellulaire est plus stable dans le temps et expliquerait en grande partie la diminution des formes graves de la maladie chez les personnes vaccinées. La collecte de ressources biologiques qui sera constituée au cours de cette étude permettra également d'optimiser ou de développer de nouvelles méthodes diagnostiques, nécessaires en complément de la vaccination, pour ralentir efficacement la propagation de la pandémie et réduire la sévérité de son impact sur la population. L'amélioration des méthodes diagnostiques permettra à son tour d'améliorer la compréhension de l'infection en fournissant des informations de plus en plus fiables sur les caractéristiques d'une infection, sa quantification, sa dynamique et sa résolution, d'autant plus que ces paramètres seront comparés, à tout moment de l'étude, aux méthodes de référence et au statut immunologique du sujet. Les principales améliorations significatives attendues dans le domaine du diagnostic du SARS-CoV-2 concernent notamment l'amélioration des performances (réduction des faux négatifs en RT-PCR sur prélèvements nasopharyngés), l'acceptabilité, la simplicité de mise en œuvre sur le terrain, et la capacité à tester la transmission. L'objectif de cette étude est d'identifier et de caractériser l'infection par le SARS-CoV-2 et la réponse de l'hôte, en particulier l'immunité muqueuse.

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