Analyse des composés organiques volatils par CPG-SM pour le diagnostic des infections respiratoires chez des patients hospitalisés à partir de l'air expiré

Les maladies respiratoires émergentes représentent une menace mondiale. Des virus tels que la grippe et les coronavirus ont été les principaux moteurs des pandémies au cours du siècle dernier. Plus largement, l'impact de ces infections respiratoires ne se limite pas aux risques de pandémie. En effet, certaines d'entre elles déclenchent également des épidémies saisonnières entraînant une charge médicale et économique importante. Il est par conséquent essentiel de renforcer la surveillance mondiale et les capacités de diagnostic des agents pathogènes responsables des infections respiratoires.

Le diagnostic des infections respiratoires revêt une importance encore plus grande en cas d'infection sévère, car il permet d'orienter et d'adapter la prise en charge du patient en fonction du pathogène responsable. Une approche prometteuse et largement reconnue est l'analyse de l'air expiré, qui contient un mélange complexe de composés organiques volatils (COV), également appelé « volatilome ». Le volatilome est influencé par le métabolisme, le système immunitaire et le microbiote du patient, et peut être perturbé par la présence d'un pathogène.

Une étude clinique parallèle, VORTEX-1, vise à établir la performance de l'analyse de l'air expiré pour le diagnostic des infections respiratoires dans le contexte de la population générale, ou pour le tri des patients aux urgences. Cette étude cible des patients présentant des infections respiratoires non sévères, majoritairement d'origine virale. Grâce à une technique spécifique, l'étude VORTEX-1 permettra de tester un processus de prélèvement et d'analyse directement sur site, indolore et avec détection chimique en temps réel.

Cette méthodologie, particulièrement adaptée aux situations de tri, reste difficile à appliquer dans le cas des infections respiratoires nécessitant une hospitalisation. En effet, les patients hospitalisés sont généralement admis dans différentes unités selon leur état clinique, leurs facteurs de risque ou la disponibilité des lits. Cette diversité des environnements rend impossible la mise en œuvre d'un processus dépendant d'un instrument qui ne peut pas être disponible ou déplacé en temps réel dans toutes les unités. Pour répondre à cette difficulté, les investigateurs utiliseront une méthode alternative.

Dans l'essai VORTEX-2, des échantillons de gaz expirés seront prélevés directement au chevet du patient à l'aide d'un dispositif à usage unique de recueil de l'air expiré. Les échantillons seront ensuite transférés vers un laboratoire pour analyse. Cette approche est plus adaptée aux infections respiratoires sévères. Afin d'être aussi complet que possible dans l'étude du volatilome dans le contexte des infections respiratoires, il est important d'inclure des patients hospitalisés et de développer un système également applicable en pratique clinique courante. Le lien entre les deux études (VORTEX-1 et VORTEX-2) sera établi par l'intermédiaire d'un groupe « témoin », constitué de sujets sains (sans infection respiratoire ni maladie sévère/chronique), dont l'air expiré sera recueilli selon les deux approches.