Construction d'une base de données diagnostique/pronostique pour les effets des variants du gène ERG humain
Construction d'une base de données diagnostique/pronostique par tests multiplexés à haut débit pour les effets des variants du gène ERG humain
Promoteur : CHU de NantesTous ses essais recensés
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- Âge annoncé
- Non précisée
- Sexes admis
- Tous
- Phase
- Non applicable
- Type d’étude
- Observationnelle
Présentation
Résumé de l’étude
Les canalopathies cardiaques provoquent des troubles graves du rythme ou de la conduction cardiaque. Les mutations du gène KCNH2, qui code pour le canal hERG (human ERG), sont responsables de 30 à 40 % de l'ensemble des cas de syndrome du QT long (LQT2 héréditaire). Par ailleurs, hERG est fréquemment responsable d'effets hors cible de plusieurs agents pharmacologiques (LQT2 acquis).
Avec l'avènement du séquençage à haut débit, des centaines de nouveaux variants du gène KCNH2 s'accumulent dans des bases de données régionales, notamment celles développées par les centres de référence français. À l'échelle mondiale, on estime qu'il existe plus de 1 000 variants du canal hERG. Malheureusement, la signification fonctionnelle de bon nombre de ces nouveaux variants demeure inconnue, malgré les informations cliniques et génétiques disponibles.
On sait peu de choses sur leur effet éventuel sur les propriétés biophysiques du canal, son expression à la surface cellulaire et/ou sa structure. Or, cette information est cruciale pour déterminer le degré réel de pathogénicité de ces variants et, par conséquent, poser le bon diagnostic de LQT2 héréditaire, conseiller le patient sur son traitement et améliorer la prise en charge de sa vie.
Notre ambition est donc de traiter cette question de la signification des variants en (i) lançant une évaluation multifonctionnelle à grande échelle des variants de hERG, (ii) introduisant pour la première fois un score formalisé d'annotation de pathogénicité à grande échelle pour tous les variants évalués fonctionnellement par cette approche multiparamétrique, et (iii) regroupant l'ensemble des informations pertinentes collectées dans chaque centre régional de référence français au sein d'une base de données nationale unique, hébergée par une infrastructure suffisamment flexible pour permettre une implémentation continue des données et un recoupement croisé.
La base de données intégrera les dernières recommandations internationales en matière d'annotation de la pathogénicité fonctionnelle. Ce projet comprendra également la caractérisation pharmacologique de plusieurs médicaments susceptibles de provoquer un LQT2 acquis de sévérité variable. Nous souhaitons comprendre s'il existe, au sein du canal hERG, des régions structurales dans lesquelles l'introduction d'un variant est davantage susceptible d'augmenter le risque de LQT2 acquis ou si, au contraire, un ensemble de variants peut relativement protéger certains patients contre les médicaments inducteurs de LQT2.
Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 15 septembre 2026. Traduction automatique par Intelligence Artificielle, sans relecture médicale. Elle peut comporter des erreurs : en cas de doute, le texte original fait foi. Le portail reprend une sélection de champs de la fiche (titre, résumé, statut, phase, sexes admis, lieux), traduits en français ; consultez la version originale pour les informations complètes.
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