Altération de l'immunité de type interféron I due à des auto-anticorps ou à un défaut génétique : une cohorte nationale prospective

Le rôle majeur des facteurs génétiques humains dans la réponse immunitaire aux infections est aujourd'hui bien établi, en particulier pour les infections virales. Dans le contexte de la pandémie de COVID-19, les résultats suivants ont permis d'identifier 1) plusieurs erreurs innées de l'immunité (EII) affectant la réponse ou la production d'interférons de type I (IFN de type I) chez environ 4 % des patients adultes présentant une forme clinique sévère, et 2) la présence d'auto-anticorps (auto-Ac) neutralisant les IFN de type I chez environ 15 % des cas sévères, et 20 % des décès.

Les investigateurs souhaitent mener une étude de suivi immunologique et clinique longitudinal sur une cohorte prospective de patients présentant soit un défaut génétique affectant la réponse immunitaire dépendante des IFN de type I, soit des auto-Ac anti-IFN-I, afin de surveiller l'incidence des événements infectieux et/ou auto-immuns chez ces individus, l'évolution du pouvoir neutralisant, et la cinétique des auto-Ac. Cela devrait permettre de mieux comprendre la prévention et la prise en charge de ces patients. Le schéma de recherche est une cohorte prospective multicentrique nationale d'adultes présentant 1) des auto-Ac anti-IFN-I ou 2) une EII-IFN-I, avec un suivi de 1 à 4 ans.

Ces individus peuvent être : 1) des patients présentant ou ayant présenté une maladie clinique (liée à la COVID-19, à d'autres infections virales, à des troubles auto-immuns) ; ou 2) des participants « sains » (par exemple, donneurs de sang, proches d'un patient atteint d'EII). Le suivi comprendra : * des visites annuelles au Centre d'Investigation Clinique (CIC) ou dans un service clinique, avec prélèvement sanguin ; * une visite spécifique en cas d'hospitalisation pour événements infectieux ou effets indésirables de la vaccination, aggravation ou nouveau diagnostic de maladie auto-immune, nouveau diagnostic de cancer, ou infection par le SARS-CoV-2, que les patients soient ou non admis à l'hôpital, avec prélèvement sanguin.

Par ailleurs, un suivi rétrospectif « passif » sera mis en œuvre par appariement avec les données du SNDS (Système National des Données de Santé), afin de recueillir les événements cliniques et la consommation de ressources de soins. De plus, un appariement avec des adultes témoins de la cohorte nationale CONSTANCES, ne présentant ni auto-Ac dirigés contre les IFN de type I ni EII-IFN-I, sera réalisé (ratio 3:1 ; appariement sur l'âge (+/- 5 ans), le sexe et la région géographique de recrutement). Les individus sous traitement immunosuppresseur ou immunomodulateur de longue durée ne seront pas éligibles.

Le suivi des témoins, réalisé dans le cadre de la cohorte CONSTANCES, comprendra des questionnaires en ligne tous les 12 mois, en plus de l'appariement avec les données du SNDS déjà réalisé dans cette cohorte. Visite d'inclusion : après signature du formulaire de consentement, les examens suivants seront réalisés : * caractéristiques démographiques (sexe, âge, pays de naissance) ; * antécédents médicaux du participant et de membre(s) de sa famille, incluant les maladies infectieuses et auto-immunes, les cancers, le statut vaccinal et les effets indésirables ; * prélèvements sanguins pour : * numération formule sanguine complète ; * bilan auto-immun classique (anticorps anti-nucléaires, anti-ENA, anti-ADN natif, anticorps anti-thyroïdiens, facteur rhumatoïde) ; * immunophénotypage* ; * auto-Ac dirigés contre les IFN de type I, d'autres cytokines*, ou d'autres protéines cibles* (dosage et activité neutralisante) ; * explorations génétiques par séquençage de l'exome ou du génome entier* ; * biobanque (ADN, plasma/sérum ; cellules mononucléées du sang périphérique (PBMC) cryoconservées). * ces analyses biologiques seront réalisées dans le cadre des lots de travail dédiés du RHU5 COVIFERON. Par ailleurs, la vaccination contre le SARS-CoV-2 et la grippe sera proposée à ces sujets en priorité, dans le cadre de leurs soins habituels.