Recherche diagnostique chez des patients atteints de maladies rares - Résoudre les maladies rares non résolues
Recherche diagnostique chez des patients atteints de maladies rares - Résoudre les maladies rares non résolues
Promoteur : Centre Hospitalier Universitaire Dijon
Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 18 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.
Texte original (anglais)
Diagnostic Research in Patients With Rare Diseases -Solving the Unsolved Rare Diseases
Diagnostic Research in Patients With Rare Diseases -Solving the Unsolved Rare Diseases
Most diagnostically unsolved rare disease have a genetic cause. These causes have not been found applying the current methodologies due to technical limitations (e.g. repeat expansions, changes in non-coding (intronic) regions) or, although methodically recorded, their pathophysiological significance but not classified as clinically relevant. A re- and meta-analysis of existing data sets with new algorithms and statistical models as well as the complementation with other omics technologies followed by functional follow-up studies in appropriate disease models (e.g. patient cell lines) allows to elucidate additional causes of diseases and improve the diagnosis of hereditary diseases. In addition to the direct examination of persons affected, the analysis of healthy family members, for example of parents, plays an important role in a so-called trio analysis, especially in the efficient filtering of the extensive data sets for newly created changes, so-called de novo- Variants (new mutations). In the context of the outlined analyzes, new disease genes can be found and validated. The gain of scientific knowledge due to a better understanding of basic cell biological mechanisms can contribute to the development of targeted therapeutic approaches. In this context, the Solve-RD project has been built and financed by the European Union with the ambitions to solve large numbers of rare disease, for which a molecular cause is not known yet by sophisticated combined omics approaches, and to improve diagnostics of rare disease patients. Solve-RD fully integrates with the newly formed European Reference Networks (ERNs) for rare diseases, and in particular the ERN-RND, -EURO-NMD, -ITHACA, and -GENTURIS. The AnDDI-Rares network is fully affiliated to the ERN ITHACA network and will actively contribute to the project, by the ambition of sharing knowledge about genes, genomic variants and phenotypes. The project will first reanalyse 18.000 negative exomes from the different ERNs performed in a diagnostic or research context (collection of biomaterial, clinical/phenotypic data plus next-generation sequencing has already been performed, and the patient/family has agreed previously in writing that their sample could be used for research related to their disease, with no study related presence required. The project will also propose new multi-omics analyses with new samples needed in 500 patients and their parents in total, justifying the AnDDI-Solve-RD project.
La plupart des maladies rares non résolues sur le plan diagnostique ont une cause génétique. Ces causes n'ont pas été identifiées avec les méthodologies actuelles en raison de limitations techniques (par exemple, expansions de répétitions, modifications dans les régions non codantes (introniques)) ou, bien que méthodiquement enregistrées, en raison de leur signification physiopathologique non classée comme cliniquement pertinente. Une réanalyse et une méta-analyse des jeux de données existants à l'aide de nouveaux algorithmes et modèles statistiques, ainsi que leur complémentation par d'autres technologies « omiques », suivies d'études fonctionnelles de suivi dans des modèles de maladie appropriés (par exemple, des lignées cellulaires de patients), permettent d'élucider des causes supplémentaires de maladies et d'améliorer le diagnostic des maladies héréditaires. Outre l'examen direct des personnes atteintes, l'analyse de membres de la famille en bonne santé, par exemple des parents, joue un rôle important dans ce que l'on appelle l'analyse en trio, en particulier pour filtrer efficacement les vastes jeux de données à la recherche de modifications nouvellement apparues, appelées variants de novo (nouvelles mutations). Dans le cadre des analyses décrites, de nouveaux gènes de maladie peuvent être identifiés et validés. Le gain de connaissances scientifiques résultant d'une meilleure compréhension des mécanismes cellulaires fondamentaux peut contribuer au développement d'approches thérapeutiques ciblées. Dans ce contexte, le projet Solve-RD a été mis en place et financé par l'Union européenne, avec pour ambition de résoudre un grand nombre de maladies rares dont la cause moléculaire est encore inconnue, grâce à des approches « omiques » combinées et sophistiquées, et d'améliorer le diagnostic des patients atteints de maladies rares. Solve-RD s'intègre pleinement aux réseaux européens de référence (ERN) nouvellement constitués pour les maladies rares, et en particulier aux réseaux ERN-RND, EURO-NMD, ITHACA et GENTURIS. Le réseau AnDDI-Rares est pleinement affilié au réseau ERN ITHACA et contribuera activement au projet, avec pour ambition de partager les connaissances sur les gènes, les variants génomiques et les phénotypes. Le projet procédera d'abord à la réanalyse de 18 000 exomes négatifs issus des différents ERN, réalisés dans un contexte diagnostique ou de recherche (le recueil de biomatériel, les données cliniques/phénotypiques ainsi que le séquençage de nouvelle génération ont déjà été effectués, et le patient/la famille a préalablement accepté par écrit que son échantillon puisse être utilisé pour la recherche liée à sa maladie, sans qu'une présence liée à l'étude soit requise). Le projet proposera également de nouvelles analyses multi-omiques avec de nouveaux échantillons nécessaires chez un total de 500 patients et leurs parents, justifiant le projet AnDDI-Solve-RD.
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