Microbiome tumoral versus microbiome luminal dans le carcinome épidermoïde de la tête et du cou
Microbiome tumoral versus microbiome luminal dans le carcinome épidermoïde de la tête et du cou
Promoteur : Centre hospitalier Sud Francilien
Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 18 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.
Texte original (anglais)
Tumoral Versus Luminal Microbiome in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
Tumoral Versus Luminal Microbiome in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC), France's 5th most common cancer (15,000 annual cases), presents significant public health challenges due to high morbidity and functional/aesthetic sequelae from treatments (mutilating surgery, radiotherapy, chemotherapy). Major risk factors, tobacco and alcohol, create a chronic inflammatory environment promoting tumor development. The upper aerodigestive tract microbiome, influenced by these exposures and local alterations (necrosis, bleeding, ulcerations), is emerging as a potential factor in tumor progression, severity biomarker, or therapeutic target, though its exact role (cause or consequence) remains to be elucidated Objectives: * Primary: Compare bacterial microbiome composition between tumor tissue, adjacent healthy mucosa, and pharyngeal secretions * Secondary: * Correlate microbiome diversity/composition with clinical and epidemiological characteristics * Identify microbiome variations by tumor stage, histology, and infiltration * Discover diagnostic/prognostic microbial markers * Analyze somatic variants (SNP/CNV) via whole-genome sequencing (WGS) and their association with microbiome profiles and clinical parameters Study Design: Prospective, cross-sectional study with paired design (each patient serves as their own control to minimize genetic variation biases) Methods: * Samples: Tumor, adjacent healthy tissue, and pharyngeal secretions (3 samples/patient) * Sequencing: Metagenomic sequencing (complete bacterial genomes) when biomass permits, or targeted 16S rRNA sequencing to identify dominant genera. * Pilot study: 20 patients to select the optimal technique and validate feasibility, particularly assessing DNA quantity in these low-biomass environments Population: Adults with suspected HNSCC scheduled for panendoscopy Exclusion criteria: Recent antibiotics/corticosteroids (12 weeks), immunosuppression (uncontrolled HIV, active hematologic malignancies, autoimmune diseases on immunosuppressants, organ/stem cell transplants, uncontrolled diabetes), immunomodulatory treatments (3 months), recurrence, pregnancy, non-French speakers, legal guardianship, or lack of social security. Safety: No additional risks beyond standard panendoscopy. Expected impact: This approach may pave the way for innovative diagnostic or therapeutic strategies based on microbiome modulation in HNSCC.
Le carcinome épidermoïde de la tête et du cou (CETC), 5e cancer le plus fréquent en France (15 000 cas annuels), pose d'importants enjeux de santé publique en raison d'une morbidité élevée et de séquelles fonctionnelles/esthétiques liées aux traitements (chirurgie mutilante, radiothérapie, chimiothérapie). Les principaux facteurs de risque, le tabac et l'alcool, créent un environnement inflammatoire chronique favorisant le développement tumoral. Le microbiome des voies aérodigestives supérieures, influencé par ces expositions et par des altérations locales (nécrose, saignements, ulcérations), apparaît comme un facteur potentiel de progression tumorale, un biomarqueur de sévérité ou une cible thérapeutique, bien que son rôle exact (cause ou conséquence) reste à élucider. Objectifs : * Principal : comparer la composition du microbiome bactérien entre le tissu tumoral, la muqueuse saine adjacente et les sécrétions pharyngées. * Secondaires : * corréler la diversité/composition du microbiome avec les caractéristiques cliniques et épidémiologiques ; * identifier les variations du microbiome selon le stade tumoral, l'histologie et l'infiltration ; * découvrir des marqueurs microbiens diagnostiques/pronostiques ; * analyser les variants somatiques (SNP/CNV) par séquençage du génome entier (WGS) et leur association avec les profils du microbiome et les paramètres cliniques. Schéma de l'étude : étude prospective, transversale, avec un plan apparié (chaque patient sert de son propre témoin afin de minimiser les biais liés à la variation génétique). Méthodes : * Échantillons : tissu tumoral, tissu sain adjacent et sécrétions pharyngées (3 échantillons/patient). * Séquençage : séquençage métagénomique (génomes bactériens complets) lorsque la biomasse le permet, ou séquençage ciblé de l'ARNr 16S pour identifier les genres dominants. * Étude pilote : 20 patients afin de sélectionner la technique optimale et de valider la faisabilité, notamment en évaluant la quantité d'ADN dans ces environnements à faible biomasse. Population : adultes présentant une suspicion de CETC et devant bénéficier d'une panendoscopie. Critères d'exclusion : antibiotiques/corticoïdes récents (12 semaines), immunosuppression (VIH non contrôlé, hémopathies malignes actives, maladies auto-immunes sous immunosuppresseurs, greffe d'organe ou de cellules souches, diabète non contrôlé), traitements immunomodulateurs (3 mois), récidive, grossesse, non-francophones, sous tutelle ou curatelle, ou absence de couverture sociale. Sécurité : aucun risque supplémentaire par rapport à une panendoscopie standard. Impact attendu : cette approche pourrait ouvrir la voie à des stratégies diagnostiques ou thérapeutiques innovantes fondées sur la modulation du microbiome dans le CETC.
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