Identification et validation clinique de biomarqueurs associés à la sévérité clinique chez les adultes infectés par le VRS

Une brève description, 5000 caractères Introduction : le virus respiratoire syncytial (VRS) est un agent fréquent et ubiquitaire des infections virales respiratoires.

Il constitue la principale cause virale d'infection des voies respiratoires basses (IVRB) chez le nourrisson et entraîne également une morbidité et une mortalité importantes chez l'adulte, en particulier chez les personnes âgées, chez les patients présentant des comorbidités cardiorespiratoires [par exemple, les patients atteints de bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO) et/ou d'insuffisance cardiaque] et chez les patients immunodéprimés.

Le phénotypage clinique des infections respiratoires à VRS a montré que la survenue d'une IVRB chez les patients infectés par le VRS est associée à la nécessité d'une assistance ventilatoire et à un risque accru de mortalité. Les données virologiques suggèrent également qu'il existe une relation entre des niveaux élevés de réplication virale nasopharyngée et un pronostic défavorable, bien que ces données n'aient pas été confirmées dans d'autres études.

Au-delà de la charge virale, l'impact des sous-types viraux sur la sévérité de l'infection à VRS est controversé. Peu de données ont exploré la valeur pronostique de la diversité génétique (c'est-à-dire le rôle des variants du VRS, les mutations survenant au cours de l'évolution clinique) chez les patients adultes infectés par le VRS présentant une insuffisance respiratoire aiguë.

Objectif : l'objectif principal de cette étude est d'identifier et de valider des biomarqueurs associés à la sévérité du VRS chez les adultes infectés par le VRS, qui seront utiles pour orienter les décisions thérapeutiques à l'avenir. Cette étude caractérisera en outre la diversité génétique jusqu'ici inconnue du VRS chez les adultes hospitalisés présentant des infections sévères et légères, afin d'anticiper les mécanismes d'échappement virologique aux traitements actuels et futurs. Méthode : il s'agit d'une étude de cohorte prospective multicentrique portant sur des patients atteints d'une infection à VRS admis à l'hôpital. Ces patients seront suivis pendant 28 jours. Des prélèvements nasopharyngés seront réalisés séquentiellement (c'est-à-dire au jour 0, au jour 3-4, au jour 5-7 et au jour 14 de l'inclusion) pour des analyses virologiques et transcriptomiques. Des prélèvements sanguins seront également effectués au jour 0 (tubes EDTA et tubes Paxgene) pour des analyses transcriptomiques périphériques et la constitution d'une banque de plasma. Les 100 premiers patients inclus dans l'étude seront affectés à la cohorte de développement et les 100 derniers patients seront affectés à la cohorte de validation.