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Étude multicentrique de patients porteurs de mutations SHANK3 : identification de gènes modificateurs dans le syndrome de Phelan-McDermid (EUQ13)

Étude multicentrique de patients porteurs de mutations SHANK3 : identification de gènes modificateurs dans le syndrome de Phelan-McDermid (EUQ13)

Promoteur : Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 16 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.

Texte original (anglais)

Multicenter Study of Patients With SHANK3 Mutations: Identification of Genes Modificators in Phelan-McDermid Syndrome (EUQ13)

Multicenter Study of Patients With SHANK3 Mutations: Identification of Genes Modificators in Phelan-McDermid Syndrome (EUQ13)

Phelan-McDermid syndrome (PMS) is a neurodevelopmental disorder with extensive clinical and genetic heterogeneity that is still poorly understood. The phenotype includes hypotonia, delayed psychomotor development, intellectual disability of varying severity, and consistent language impairment ranging from delayed to absent speech. Autism spectrum disorders are present in 60-80% of patients, and other comorbidities may be present. The major candidate gene for PMS is SHANK3, which encodes a scaffolding protein in the dense postsynaptic region of glutamatergic synapses. Its loss of function is caused by deletions in the distal region of chromosome 22, 22q13.3, or by intragenic genomic variants. Several studies, including the one conducted by our team, have shown that part of the variability in the phenotype is related to the size of the 22q13.3 deletion. However, two patients with a deletion of similar size or an identical point variation in SHANK3 can have phenotypes of very variable severity. The existence of additional genomic variants not identified by standard diagnostic techniques, particularly DNA chip chromosomal analysis (ACPA), which may act as modulating elements of the phenotype, has been suggested. The limitations of the proposed studies are the highly heterogeneous genomic tools used (variable DNA chip design in terms of probe distribution and resolution) and the often imprecise phenotypes. Our study will bring together a large number of SPM patients (related to a 22q13.3 deletion or a variation of the SHANK3 gene) as well as their parents and possible relatives (first or second degree of the patient), very well phenotyped and explored by complete genome sequencing on the same sequencing platform.

Le syndrome de Phelan-McDermid (SPM) est un trouble du neurodéveloppement présentant une hétérogénéité clinique et génétique importante, encore mal comprise. Le phénotype comprend une hypotonie, un retard du développement psychomoteur, une déficience intellectuelle de sévérité variable, ainsi qu'une atteinte constante du langage allant du retard à l'absence totale de langage. Les troubles du spectre de l'autisme sont présents chez 60 à 80 % des patients, et d'autres comorbidités peuvent être présentes. Le gène candidat majeur du SPM est SHANK3, qui code une protéine d'échafaudage de la région postsynaptique dense des synapses glutamatergiques. Sa perte de fonction est causée par des délétions de la région distale du chromosome 22, en 22q13.3, ou par des variants génomiques intragéniques. Plusieurs études, y compris celle menée par notre équipe, ont montré qu'une partie de la variabilité du phénotype est liée à la taille de la délétion 22q13.3. Toutefois, deux patients présentant une délétion de taille similaire ou un variant ponctuel identique dans SHANK3 peuvent présenter des phénotypes de sévérité très variable. L'existence de variants génomiques supplémentaires non identifiés par les techniques diagnostiques standard, en particulier l'analyse chromosomique sur puce à ADN (ACPA), susceptibles d'agir comme des éléments modulateurs du phénotype, a été suggérée. Les limites des études proposées tiennent à la grande hétérogénéité des outils génomiques utilisés (conception variable des puces à ADN en termes de répartition et de résolution des sondes) et à des phénotypes souvent imprécis. Notre étude réunira un grand nombre de patients atteints de SPM (lié à une délétion 22q13.3 ou à un variant du gène SHANK3), ainsi que leurs parents et éventuels apparentés (au premier ou au deuxième degré du patient), très bien phénotypés et explorés par séquençage du génome complet sur la même plateforme de séquençage.

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