Étude exploratoire monocentrique du microbiote intestinal chez des patients traités pour un syndrome de l'intestin irritable à prédominance de constipation et production de méthane

Le syndrome de l'intestin irritable (SII), défini par les critères de Rome IV, est un trouble fonctionnel intestinal associant des douleurs abdominales à des modifications du transit et/ou de la consistance des selles. Cette affection est fréquente, touchant 5 % à 10 % de la population des pays développés. L'étiologie du SII est multifactorielle, impliquant des troubles de la motricité intestinale, une hypersensibilité viscérale, une micro-inflammation de la muqueuse intestinale et une dysbiose.

Il a été démontré que la sous-catégorie de patients atteints de SII avec constipation présente préférentiellement des quantités accrues de Methanobrevibacter smithii, l'archée méthanogène la plus fréquemment retrouvée dans la lumière intestinale, par rapport aux autres patients atteints de SII. Les tests respiratoires permettent d'évaluer la production de méthane par le microbiote intestinal, ce qui reflète indirectement la présence et la quantité d'archées méthanogènes. L'acronyme IMO (intestinal methanogen overgrowth, pullulation méthanogène intestinale) désigne l'association de symptômes digestifs (notamment ballonnements et constipation) avec une concentration élevée de méthane dans les gaz expirés (≥ 10 ppm).

Les liens entre constipation, production de méthane et microbiote fécal restent incertains, ce qui justifie la réalisation d'études complémentaires pouvant conduire à des recommandations diagnostiques et thérapeutiques précises. Objectif principal : décrire la composition initiale du microbiote fécal des patients atteints de SII avec constipation et production de méthane. Objectifs secondaires : 2. Décrire la composition initiale des métabolites sanguins liés au microbiote des patients atteints de SII avec constipation et production de méthane. 3.

Décrire l'évolution du microbiote fécal et des métabolites sanguins liés au microbiote fécal au cours de la prise en charge thérapeutique conventionnelle (avant et après) des patients atteints de SII avec constipation et production de méthane. 4. Comparer la composition du microbiote fécal avant et après la prise en charge thérapeutique conventionnelle des patients atteints de SII-C répondeurs (-30 % sur le score de sévérité des symptômes IBS-SSS) par rapport aux patients non répondeurs. 5. Évaluer l'impact de Methanobrevibacter smithii dans la réponse au traitement symptomatique.

Étude observationnelle monocentrique exploratoire (suivi de cohorte), descriptive, chez des patients atteints d'un syndrome de l'intestin irritable avec constipation (SII-C, SII-m ou SII-U) présentant une production excessive de méthane détectée lors d'un test respiratoire au glucose. Les patients seront invités à participer une fois les résultats du test respiratoire connus. À noter : dans le cadre de cette étude, seuls deux prélèvements de microbiote, 4 tubes supplémentaires ainsi qu'un tube de sang seront ajoutés à la pratique habituelle. Tous les traitements seront prescrits dans le cadre des soins et ne sont pas conditionnés par le protocole de recherche. Le critère de jugement principal est l'analyse de la composition initiale (séquençage du gène ARNr 16S) du microbiote fécal des patients atteints de SII avec constipation et production de méthane. La population de l'étude est constituée de patients atteints de SII avec constipation et production excessive de méthane, vus dans le service d'explorations fonctionnelles digestives pour un test respiratoire prescrit dans le cadre d'une consultation externe ou d'une hospitalisation de jour. Un total de 40 patients sera inclus sur 18 mois, avec une durée de participation de 2 mois +/- 2 mois par sujet. Les patients atteints de SII constituent une population hétérogène pour laquelle seul un traitement symptomatique est actuellement proposé, avec une efficacité variable et imprévisible. Ce travail vise à rechercher de nouveaux axes thérapeutiques permettant de soulager, voire de traiter, leurs symptômes.