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Épidémiologie et évolution génomique au fil du temps de Klebsiella pneumoniae et d'Enterobacter cloacae complex (ECC) dans les selles de patients d'ICU

Titre et résumé traduits de l’anglais par le portail, à partir de la fiche publiée par le registre source, le 13 septembre 2026. Traduction automatique, sans relecture médicale : elle ne modifie ni n’interprète le contenu ; en cas de doute, le texte original fait foi.

Texte original (anglais)

Epidemiology and Overtime Genomic Evolution of Klebsiella Pneumoniae and Enterobacter Cloacae Complex (ECC) in Stools of ICU's Patients

Infections are one of the major threats for inpatients, even more for patients hospitalized in intensive care units (ICUs). They are responsible for an important increase of morbidity and mortality rates as well as a burst of medical costs since approximatively 50% of ICU patients acquire an infection during their hospitalization and 60% of attributable deaths (Vincent et al. 2009). In ICUs, patients are commonly colonized or infected by a small contingent of multidrug-resistant (MDR) isolates gathered under the acronym "ESKAPE bugs" for Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp. (Pendleton et al. 2013; Rice 2010; Reardon 2014). Moreover, it is clearly established now, that epidemiological characterization in K. pneumoniae and E. cloacae isolates seemed to be an major step due to the existence of potential hyper-virulent and/or multidrug resistant strains (Lam et al. 2018; Moradigaravand et al. 2016). The aim of this study is the investigation of the overtime clonal diversity evolution of Klebsiella pneumoniae (Kpn) and Enterobacter cloacae complex (ECC) strains in long-term hospitalized patients (more than 28 days of hospitalization). To assess that objective, we will undertake a longitudinal monocentric, prospective study, based on weekly stool's samples done in ICUs patients and sent to our laboratory for MDR bacteria screening during their stay in reanimation wards and also, if possible, in their downstream wards especially in neurosurgery.

Les infections constituent l'une des principales menaces pour les patients hospitalisés, plus encore pour les patients hospitalisés en unités de soins intensifs (ICUs). Elles sont responsables d'une augmentation importante des taux de morbidité et de mortalité, ainsi que d'une explosion des coûts médicaux, puisqu'environ 50% des patients d'ICU acquièrent une infection au cours de leur hospitalisation, et 60% des décès leur sont attribuables (Vincent et al. 2009). En ICU, les patients sont couramment colonisés ou infectés par un contingent restreint d'isolats multirésistants (MDR), regroupés sous l'acronyme « ESKAPE bugs » pour Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa et Enterobacter spp. (Pendleton et al. 2013 ; Rice 2010 ; Reardon 2014). De plus, il est désormais clairement établi que la caractérisation épidémiologique des isolats de K. pneumoniae et d'E. cloacae semble être une étape majeure, en raison de l'existence de souches potentiellement hypervirulentes et/ou multirésistantes (Lam et al. 2018 ; Moradigaravand et al. 2016). L'objectif de cette étude est d'étudier l'évolution de la diversité clonale au fil du temps des souches de Klebsiella pneumoniae (Kpn) et d'Enterobacter cloacae complex (ECC) chez des patients hospitalisés au long cours (plus de 28 jours d'hospitalisation). Pour répondre à cet objectif, nous mènerons une étude longitudinale, monocentrique et prospective, basée sur des prélèvements de selles hebdomadaires effectués chez des patients d'ICU et envoyés à notre laboratoire pour le dépistage des bactéries MDR pendant leur séjour dans les services de réanimation, ainsi que, si possible, dans leurs services d'aval, en particulier en neurochirurgie.

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